Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms