Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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PCDHB16Q9NRJ7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDHB16Q9NRJ7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDHB16Q9NRJ7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDHB16Q9NRJ7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDHB16Q9NRJ7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDHB16Q9NRJ7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDHB16Q9NRJ7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PCDHB16Q9NRJ7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDHB16Q9NRJ7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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PCDHB16Q9NRJ7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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PCDHB16Q9NRJ7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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PCDHB16Q9NRJ7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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PCDHB16Q9NRJ7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDHB16Q9NRJ7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDHB16Q9NRJ7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDHB16Q9NRJ7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCDHB16Q9NRJ7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PCDHB16Q9NRJ7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PCDHB16Q9NRJ7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCDHB16Q9NRJ7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PCDHB16Q9NRJ7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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