Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 AL591806.3-202ENST00000470694 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 220.59■□□□□ 0.897e-7■■■■■ 147.8
UTP3Q9NQZ2 F11R-205ENST00000602966 558 ntTSL 415.98■□□□□ 0.157e-7■■■■■ 147.8
UTP3Q9NQZ2 F11R-201ENST00000335772 571 ntTSL 415.98■□□□□ 0.157e-7■■■■■ 147.8
UTP3Q9NQZ2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 147.7
UTP3Q9NQZ2 PPP2R5C-229ENST00000557621 759 ntTSL 59.06□□□□□ -0.967e-7■■■■■ 147.7
UTP3Q9NQZ2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 147.6
UTP3Q9NQZ2 GALNS-204ENST00000562831 609 ntTSL 325.8■■□□□ 1.724e-8■■■■■ 147.5
UTP3Q9NQZ2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.074e-8■■■■■ 147.5
UTP3Q9NQZ2 GALNS-203ENST00000562593 5682 ntTSL 1 (best)19.29■□□□□ 0.684e-8■■■■■ 147.5
UTP3Q9NQZ2 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 147.5
UTP3Q9NQZ2 GALNS-209ENST00000567525 1953 ntTSL 215.28■□□□□ 0.044e-8■■■■■ 147.5
UTP3Q9NQZ2 GALNS-212ENST00000568613 1804 ntTSL 213.83□□□□□ -0.24e-8■■■■■ 147.5
UTP3Q9NQZ2 PKN2-203ENST00000370521 6121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 147.5
UTP3Q9NQZ2 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 147.5
UTP3Q9NQZ2 GALNS-208ENST00000566563 456 ntTSL 35.58□□□□□ -1.524e-8■■■■■ 147.5
UTP3Q9NQZ2 CDYL-204ENST00000440139 690 ntTSL 38.72□□□□□ -1.016e-7■■■■■ 147.5
UTP3Q9NQZ2 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 147.4
UTP3Q9NQZ2 CYTH1-213ENST00000590775 582 ntTSL 521.45■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 147.4
UTP3Q9NQZ2 AC104123.1-201ENST00000502645 473 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 147.4
UTP3Q9NQZ2 AC104123.1-202ENST00000511775 581 ntTSL 4 BASIC8.82□□□□□ -13e-8■■■■■ 147.4
UTP3Q9NQZ2 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.387e-8■■■■■ 147.4
UTP3Q9NQZ2 SSBP3-201ENST00000326956 2913 ntTSL 215.67■□□□□ 0.19e-7■■■■■ 147.4
UTP3Q9NQZ2 ATP11A-210ENST00000471555 5786 ntTSL 1 (best)13.73□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 147.2
UTP3Q9NQZ2 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.564e-8■■■■■ 147.2
UTP3Q9NQZ2 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 147.2
UTP3Q9NQZ2 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -02e-6■■■■■ 147.2
UTP3Q9NQZ2 RNF216-201ENST00000389900 3104 ntTSL 1 (best)11.4□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 147.2
UTP3Q9NQZ2 FBXO34-204ENST00000555087 612 ntTSL 420.19■□□□□ 0.821e-13■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 TBC1D9B-217ENST00000522472 668 ntTSL 514.93□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 FBXO34-202ENST00000440021 2831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.21e-13■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 FBXO34-206ENST00000557647 434 ntTSL 38.72□□□□□ -1.011e-13■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-210ENST00000587463 461 ntTSL 519.55■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-223ENST00000591736 573 ntTSL 419.55■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-215ENST00000588879 535 ntTSL 519.55■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-224ENST00000591881 575 ntTSL 518.2■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-217ENST00000589886 472 ntTSL 416.95■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-211ENST00000587479 547 ntTSL 416.73■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-221ENST00000591124 575 ntTSL 415.81■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-208ENST00000587263 579 ntTSL 515.58■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-229ENST00000592771 1937 ntTSL 1 (best)15.23■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-225ENST00000592133 562 ntTSL 412.85□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-202ENST00000340578 3233 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-228ENST00000592621 818 ntTSL 512.49□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-203ENST00000439268 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-207ENST00000587159 554 ntTSL 511.43□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-205ENST00000586117 524 ntTSL 411.13□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-216ENST00000589353 490 ntTSL 510.72□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-219ENST00000590953 571 ntTSL 310.61□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-218ENST00000590623 786 ntTSL 58.82□□□□□ -11e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-204ENST00000585339 566 ntTSL 47.9□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 RANBP3-214ENST00000588010 568 ntTSL 56.49□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 TM9SF2-201ENST00000376387 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.394e-8■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.179e-7■■■■■ 147
UTP3Q9NQZ2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 146.9
UTP3Q9NQZ2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.473e-7■■■■■ 146.9
UTP3Q9NQZ2 GIGYF2-220ENST00000440945 2658 ntTSL 1 (best)10.22□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 146.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 146.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 146.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 146.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 146.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 146.8
UTP3Q9NQZ2 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 146.8
UTP3Q9NQZ2 ADAR-206ENST00000494866 471 ntTSL 215.57■□□□□ 0.085e-10■■■■■ 146.8
UTP3Q9NQZ2 ADAR-204ENST00000471068 577 ntTSL 412.48□□□□□ -0.415e-10■■■■■ 146.8
UTP3Q9NQZ2 ADAR-207ENST00000526905 490 ntTSL 38.1□□□□□ -1.115e-10■■■■■ 146.8
UTP3Q9NQZ2 ILF3-221ENST00000591649 2579 ntTSL 215.54■□□□□ 0.081e-9■■■■■ 146.8
UTP3Q9NQZ2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 146.7
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC3-204ENST00000419642 540 ntTSL 514.58□□□□□ -0.081e-12■■■■■ 146.7
UTP3Q9NQZ2 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.337e-7■■■■■ 146.7
UTP3Q9NQZ2 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.287e-7■■■■■ 146.7
UTP3Q9NQZ2 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 146.7
UTP3Q9NQZ2 AL138720.1-202ENST00000437648 1017 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 146.6
UTP3Q9NQZ2 GATAD2B-201ENST00000368655 7478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 146.4
UTP3Q9NQZ2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.561e-15■■■■■ 146.4
UTP3Q9NQZ2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 146.3
UTP3Q9NQZ2 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 146.3
UTP3Q9NQZ2 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 146.3
UTP3Q9NQZ2 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 146.3
UTP3Q9NQZ2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 146.3
UTP3Q9NQZ2 SPRED1-202ENST00000561205 1177 ntTSL 522.8■■□□□ 1.249e-7■■■■■ 146.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 146.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-208ENST00000536265 3603 ntTSL 512.58□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 146.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-213ENST00000539049 3471 ntTSL 512.4□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 146.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-201ENST00000228264 3717 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 146.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-204ENST00000435753 4182 ntTSL 511.29□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 146.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-202ENST00000350437 3724 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 146.2
UTP3Q9NQZ2 DDX11-229ENST00000545668 3751 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 146.2
UTP3Q9NQZ2 SPRED1-203ENST00000561317 527 ntTSL 47.32□□□□□ -1.249e-7■■■■■ 146.2
UTP3Q9NQZ2 NSD2-214ENST00000505643 990 ntTSL 317.99■□□□□ 0.472e-8■■■■■ 146.2
UTP3Q9NQZ2 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 02e-8■■■■■ 146.2
UTP3Q9NQZ2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.597e-7■■■■■ 146.1
UTP3Q9NQZ2 SLC7A11-202ENST00000509248 797 ntTSL 56.8□□□□□ -1.324e-8■■■■■ 146.1
UTP3Q9NQZ2 PDXK-215ENST00000476313 1704 ntTSL 321.94■■□□□ 1.15e-8■■■■■ 146.1
UTP3Q9NQZ2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.415e-8■■■■■ 146.1
UTP3Q9NQZ2 BRWD1-210ENST00000446924 4990 ntTSL 24.65□□□□□ -1.675e-9■■■■■ 146.1
UTP3Q9NQZ2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 146
UTP3Q9NQZ2 ADCY7-210ENST00000567277 2304 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 146
UTP3Q9NQZ2 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 146
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1084.4 ms