Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FZD3Q9NPG1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FZD3Q9NPG1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms