Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GOPCQ9HD26 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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