Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KIAA1549Q9HCM3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms