Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RAB1BQ9H0U4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RAB1BQ9H0U4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB1BQ9H0U4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB1BQ9H0U4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB1BQ9H0U4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB1BQ9H0U4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RAB1BQ9H0U4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB1BQ9H0U4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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