Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG0

B3GNT5, Lactosylceramide 1,3-N-acetyl-beta-D-glucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT5Q9BYG0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
B3GNT5Q9BYG0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms