Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAPERQ9BY12 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAPERQ9BY12 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms