Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRRTQ9BXP5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms