Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf16Q9BUW7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms