Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SEC22CQ9BRL7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SEC22CQ9BRL7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SEC22CQ9BRL7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SEC22CQ9BRL7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SEC22CQ9BRL7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEC22CQ9BRL7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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