Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EBF4Q9BQW3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms