Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RBBP8Q99708 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms