Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VAT1Q99536 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms