Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MYCBPQ99417 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms