Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
SIN3AQ96ST3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIN3AQ96ST3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms