Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCLRE1CQ96SD1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms