Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C9orf72Q96LT7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
C9orf72Q96LT7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms