Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRIQ1Q96JM4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRIQ1Q96JM4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
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