Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIRT1Q96EB6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIRT1Q96EB6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms