Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NXPE2Q96DL1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms