Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NKD2Q969F2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NKD2Q969F2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms