Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FNDC8Q8TC99 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms