Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SEMA6DQ8NFY4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SEMA6DQ8NFY4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms