Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ANKRD53Q8N9V6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms