Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GCSAMQ8N6F7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GCSAMQ8N6F7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms