Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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C9orf40Q8IXQ3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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C9orf40Q8IXQ3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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C9orf40Q8IXQ3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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C9orf40Q8IXQ3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf40Q8IXQ3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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