Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC50Q8IVM0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms