Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SSH2Q76I76 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SSH2Q76I76 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms