Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWN0

LYPD4, Ly6/PLAUR domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD4Q6UWN0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LYPD4Q6UWN0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms