Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ETFRF1Q6IPR1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms