Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CARMIL2Q6F5E8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CARMIL2Q6F5E8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms