Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ANKRD40Q6AI12 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ANKRD40Q6AI12 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms