Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUP188Q5SRE5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms