Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ODF2Q5BJF6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms