Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB6CQ53S08 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms