Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP41Q3LFD5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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