Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TWISTNBQ3B726 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms