Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms