Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SGSM1Q2NKQ1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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