Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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