Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HIST3H3Q16695 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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