Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FSCN1Q16658 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FSCN1Q16658 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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