Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FXNQ16595 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FXNQ16595 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FXNQ16595 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FXNQ16595 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FXNQ16595 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FXNQ16595 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FXNQ16595 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FXNQ16595 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FXNQ16595 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FXNQ16595 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FXNQ16595 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FXNQ16595 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FXNQ16595 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FXNQ16595 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FXNQ16595 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms