Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMD5Q16401 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMD5Q16401 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms