Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NEDD8Q15843 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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