Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TRIP13Q15645 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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TRIP13Q15645 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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TRIP13Q15645 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms