Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCOLCEQ15113 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms