Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PSMD6Q15008 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms